点击右上角
微信好友
朋友圈
请使用浏览器分享功能进行分享
提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
陈建仁被曝以“借调”方式接替苏贞昌，岛内批“好处占尽，不愿吃亏”******
【环球时报综合报道】陈建仁声称要承担蔡英文的“最后一里路”，以“义无反顾”来描述自己接任台“行政院长”的心境，却被爆出并未辞去“中研院”特聘研究员的职位，而是以借调留职停薪的方式为自己解套。
台湾《中国时报》1月29日披露称，陈建仁是台“中研院”基因体研究中心特聘研究员。“中研院”证实，蔡英文办公室1月27日去函借调陈建仁担任“行政院长”；借调期间应办理留职停薪，并在借调机关支薪。报道称，依据台“中研院研究所组织规程”规定，能获特聘研究员职务的学者，不仅大多具备“院士”身份，而且任期更不受年龄限制，聘期由“中研院院长”提请院务会议决定。他们的薪资很高，对比一般研究员10万元(新台币，下同)左右的月薪，特聘研究员依照等级高低，从13万元到49万元不等。依陈建仁的分量，月薪是49万元。
台“行政院”准发言人陈宗彦1月30日声称，教育、研究机关借调并非首例，所有程序都是根据规定完成。但陈建仁的举动无疑令人感到“好处占尽，就是不愿吃亏一下”。国民党“立委”洪孟楷1月30日质问道，陈建仁预留后路随时走人，也能回“中研院”继续领高薪，到底是对民进党没信心还是对自己的任期没信心？他批评陈缺乏破釜沉舟的决心，要期待有什么大刀阔斧的改革，恐怕缘木求鱼。国民党主席朱立伦表示，如果陈建仁是这样的心态，那就是一个“看守内阁”和“过渡内阁”，准备要交班给国民党。“中广”董事长赵少康痛批，之前传陈建仁因舍不得“中研院”的高薪，对是否接任“行政院长”踌躇再三，现在又摆出愿意“牺牲”的样子，看来是蔡英文答应他保有“中研院”特聘研究员的高薪空缺，“又要当最大官，又舍不得放弃高薪，所有好处都给他占，看得出他对出任行政院长的过水心态”。赵少康还说，蔡英文拼命删减退休军公教人员退休年金，却把民脂民膏浪费在民进党退职大官身上。台北市议员游淑慧直批陈建仁这笔账算得很精，一点亏都不愿意吃。
《中国时报》评论称，虽然“行政院长”月薪也有32万元，但“中研院”特聘研究员可以活到老、领到老，似乎更香。陈建仁嘴上说“回馈、承担”，另一只手却又紧紧抓住高薪和名位不放，社会观感不佳。(陈立非）
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
彩虹多多地图 |
)